!temporary potential file until read_force_field_charmm is fully functional !params taken from charmm27 force field !CXX atom is CT3 atom with different charge for use with deca_ala.pdb BONDS HA CT3 322.000 1.1110 CT3 C 250.000 1.4900 O C 620.000 1.2300 NH1 C 370.000 1.3450 NH1 H 440.000 0.9970 NH1 CT1 320.000 1.4300 HB CT1 330.000 1.0800 CT3 CT1 222.500 1.5380 CT1 C 250.000 1.4900 NH1 CT3 320.000 1.4300 !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX HA CXX 322.000 1.1110 NH1 CXX 320.000 1.4300 !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ANGLES HA CT3 HA 35.500 108.40 5.40 1.80200 HA CT3 C 33.000 109.50 30.00 2.16300 O C CT3 80.000 121.0000 NH1 C CT3 80.000 116.5000 O C NH1 80.000 122.5000 H NH1 C 34.000 123.0000 CT1 NH1 C 50.000 120.0000 H NH1 CT1 35.000 117.0000 NH1 CT1 HB 48.000 108.0000 NH1 CT1 CT3 70.000 113.5000 NH1 CT1 C 50.000 107.0000 HB CT1 CT3 35.000 111.0000 HB CT1 C 50.000 109.5000 CT3 CT1 C 52.000 108.0000 HA CT3 CT1 33.430 110.10 22.53 2.17900 O C CT1 80.000 121.0000 NH1 C CT1 80.000 116.5000 NH1 C CT3 80.000 116.5000 CT3 NH1 C 50.000 120.0000 H NH1 CT3 35.000 117.0000 NH1 CT3 HA 51.500 109.5000 !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX CXX NH1 C 50.000 120.0000 H NH1 CXX 35.000 117.0000 NH1 CXX HA 51.500 109.5000 HA CXX HA 35.500 108.40 5.40 1.80200 !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX DIHEDRALS O C CT3 HA 0.0000 3 180.00 NH1 C CT3 HA 0.0000 3 0.00 H NH1 C CT3 2.5000 2 180.00 CT3 NH1 C CT1 1.6000 1 0.00 CT3 C NH1 CT1 1.6000 1 0.00 CT3 C NH1 CT1 2.5000 2 180.00 O C NH1 H 2.5000 2 180.00 O C NH1 CT1 2.5000 2 180.00 HB CT1 NH1 C 0.0000 1 0.00 CT3 CT1 NH1 C 1.8000 1 0.00 C CT1 NH1 C 0.2000 1 180.00 HB CT1 NH1 H 0.0000 1 0.00 H NH1 CT1 CT3 0.0000 1 0.00 H NH1 CT1 C 0.0000 1 0.00 O C CT1 NH1 0.0000 1 0.00 NH1 C CT1 NH1 0.6000 1 0.00 O C CT1 HB 0.0000 1 0.00 NH1 C CT1 HB 0.0000 1 0.00 O C CT1 CT3 1.4000 1 0.00 NH1 C CT1 CT3 0.0000 1 0.00 H NH1 C CT1 2.5000 2 180.00 CT1 C NH1 CT1 1.6000 1 0.00 CT1 C NH1 CT1 2.5000 2 180.00 O C NH1 CT3 2.5000 2 180.00 HA CT3 NH1 C 0.0000 3 0.00 HA CT3 NH1 H 0.0000 3 0.00 X CT1 CT3 X 0.2000 3 0.00 !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX C CT1 CT3 HA 0.2000 3 0.00 HB CT1 CT3 HA 0.2000 3 0.00 NH1 CT1 CT3 HA 0.2000 3 0.00 CXX NH1 C CT1 1.6000 1 0.00 O C NH1 CXX 2.5000 2 180.00 HA CXX NH1 C 0.0000 3 0.00 HA CXX NH1 H 0.0000 3 0.00 !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX IMPROPER C CT3 O NH1 120.0000 0 0.0000 NH1 C H CT1 20.0000 0 0.0000 C CT1 O NH1 120.0000 0 0.0000 NH1 C H CXX 20.0000 0 0.0000 NONBONDED CT3 0.000000 -0.080000 2.060000 0.000000 -0.010000 1.900000 HA 0.000000 -0.022000 1.320000 C 0.000000 -0.110000 2.000000 O 0.000000 -0.120000 1.700000 0.000000 -0.120000 1.400000 NH1 0.000000 -0.200000 1.850000 0.000000 -0.200000 1.550000 H 0.000000 -0.046000 0.224500 CT1 0.000000 -0.020000 2.275000 0.000000 -0.010000 1.900000 HB 0.000000 -0.022000 1.320000 !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX CXX 0.000000 -0.080000 2.060000 0.000000 -0.010000 1.900000 !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX !XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX HBOND CUTHB 0.5 END